Margit Neubauer kam 1977 an die Oper Frankfurt, wo sie sich ein umfangreiches Repertoire erarbeitete, darunter die Partien Sesto (Giulio Cesare), Hänsel (Hänsel und Gretel), Dalila (Samson et Dalila), Idamante (Idomeneo) und Carmen. Auch an der Uraufführung von John Cages Europeras 1 & 2 wirkte die Mezzosopranistin mit. Zuletzt war sie auf der Bühne u.a. als La badessa (Suor Angelica) in Puccinis Il trittico, Háta in Smetanas Die verkaufte Braut, Marthe in Gounods Faust, die Frau des Dorfrichters in Janáčeks Jenufa und Russische Gouvernante in Brittens Death in Venice präsent. Gastspiele führten sie nach Berlin, Hamburg, Zürich, Amsterdam, Jerusalem und Los Angeles, wo sie Cherubino (Le nozze di Figaro), Brigitta in Korngolds Die tote Stadt und die Titelpartie in Antonio Bibalos Fräulein Julie gestaltete. Sie hat mit namhaften Regisseuren und Dirigenten zusammengearbeitet. 1993 wurde Margit Neubauer an der Oper Frankfurt zur Kammersängerin ernannt.